Для лечения применяют листья, семена (репьи) и корни.
Корни растений первого года выкапывают в конце апреля-начале мая, когда у него еще нет стеблей, но появились листья, или в сентябре-октябре, когда листья высохли. Дряблые и деревянистые корни для лечебных целей непригодны.
Сочные корни провяливают на солнце, после чего руками снимают с них землю. Ни в коем случае нельзя снимать с корней кожицу — в ней содержится много полезных веществ. Сушат корни лопуха без промедления, разрезая вдоль на куски по 10 — 15 см, в сушилках или духовках при температуре 40°С.
Корни лопуха используют как мочегонное средство при мочекаменной болезни, отеках, как жаропонижающее и потогонное при простудных заболеваниях, как болеутоляющее и восстанавливающее обмен веществ при подагре, суставном ревматизме, геморрое, а также наружно — для лечения кожных заболеваний (экземы, язв, кожной сыпи, гнойных ран, фурункулеза).
В народной медицине корни лопуха применяют в виде настоя, отвара, настойки и репейного масла.
Листья лопуха используют как желчегонное средство, а также при ожогах и ранах. Сок листьев применяется для выведения бородавок, при чесотке, он хорошо заживляет раны.